Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms