Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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LINC00587B1AMM8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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LINC00587B1AMM8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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LINC00587B1AMM8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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LINC00587B1AMM8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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LINC00587B1AMM8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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LINC00587B1AMM8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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