Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCP1A6NGW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
STRCP1A6NGW2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms