Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms