Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PRR13P2-201ENST00000533804 406 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LRTOMT-216ENST00000539271 570 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PRSS58-201ENST00000547058 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02345-202ENST00000558081 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC112484.4-201ENST00000567253 811 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 DYM-207ENST00000578396 755 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC008649.2-201ENST00000585999 242 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC020907.2-202ENST00000592174 728 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL080285.2-201ENST00000612765 458 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL591926.6-201ENST00000617375 415 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CYP4A11-204ENST00000462347 1775 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC02059-202ENST00000506471 2094 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ALDH7A1-227ENST00000636879 2501 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC02539-201ENST00000411615 737 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 BMP2KL-201ENST00000414251 1225 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL353611.1-201ENST00000417054 462 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR7E36P-201ENST00000419933 954 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL049734.1-201ENST00000422384 608 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P21-201ENST00000478287 635 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 C5orf58-206ENST00000593851 509 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 NAPA-AS1-202ENST00000594367 630 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GLTP-206ENST00000617457 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CU633967.1-202ENST00000623449 560 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 COMMD6-205ENST00000406936 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GBP7-201ENST00000294671 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL512504.2-201ENST00000445455 1909 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FBXW7-207ENST00000603841 2261 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC002064.1-201ENST00000445784 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AF186996.8-201ENST00000463158 907 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms