Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 UBE2D3-205ENST00000350435 711 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTL8BQ17RB0 BCL2L15-202ENST00000393316 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTL8BQ17RB0 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTL8BQ17RB0 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTL8BQ17RB0 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CREM-218ENST00000460270 1416 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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