Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC117498.2-202ENST00000549864 473 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC02330-201ENST00000557784 555 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC092287.1-201ENST00000565782 463 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC087393.2-201ENST00000580962 504 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC006130.1-201ENST00000589365 555 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HIGD1B-205ENST00000591513 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL445223.1-201ENST00000595998 1051 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC000068.3-201ENST00000607934 427 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TTC23L-208ENST00000610313 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC131159.2-201ENST00000613236 702 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC099654.4-201ENST00000614168 1059 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC244669.1-201ENST00000616141 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC01358-208ENST00000634569 1030 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 THNSL1-202ENST00000524413 3788 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CD200-203ENST00000473539 1524 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SERPINA9-202ENST00000337425 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SCOC-AS1-201ENST00000512692 1987 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MS4A2-201ENST00000278888 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC003080.1-201ENST00000413552 767 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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PDCD1Q15116 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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PDCD1Q15116 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 HOXB-AS1-203ENST00000504972 680 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NDFIP1P1-201ENST00000543144 525 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01588-211ENST00000556434 892 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01572-203ENST00000563823 563 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC090912.1-201ENST00000578831 570 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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