Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC01644-201ENST00000405369 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PPIAP2-201ENST00000414143 492 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL034397.1-201ENST00000456392 908 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 UGT2B29P-201ENST00000509021 973 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SDHC-208ENST00000513009 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MTND6P20-201ENST00000522986 418 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR4A11P-201ENST00000529557 906 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC016876.3-201ENST00000610459 426 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC104237.3-201ENST00000611809 427 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HGF-209ENST00000457544 2249 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GLRX-201ENST00000237858 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL772337.2-201ENST00000411992 981 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC01363-201ENST00000426709 971 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC009228.1-203ENST00000430105 432 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RPS10P2-201ENST00000430953 494 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NUTF2P5-201ENST00000475013 379 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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