Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 DBN1-205ENST00000471767 428 ntTSL 514.62□□□□□ -0.073e-10■■□□□ 11.7
PRPF8Q6P2Q9 FNDC3B-210ENST00000483344 666 ntTSL 31.88□□□□□ -2.116e-13■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 513.45□□□□□ -0.264e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 RGL2-246ENST00000494550 1027 ntTSL 315.94■□□□□ 0.143e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 RGL2-242ENST00000478610 1009 ntTSL 311.1□□□□□ -0.633e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ARRDC1-202ENST00000419386 829 ntTSL 318.11■□□□□ 0.492e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 TNS2-206ENST00000546772 678 ntTSL 513.24□□□□□ -0.291e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 211.52□□□□□ -0.564e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.195e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SERPINF2-204ENST00000453066 842 ntTSL 514.6□□□□□ -0.073e-10■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.61e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 MINOS1-208ENST00000498067 481 ntTSL 218.36■□□□□ 0.539e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 MINOS1-204ENST00000479642 576 ntTSL 313.87□□□□□ -0.199e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NR5A1-203ENST00000455734 826 ntTSL 312.45□□□□□ -0.429e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SENP3-209ENST00000610454 606 ntTSL 311.4□□□□□ -0.589e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-231ENST00000551746 734 ntTSL 411.03□□□□□ -0.649e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-218ENST00000548822 595 ntTSL 410.32□□□□□ -0.769e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-209ENST00000546557 1068 ntTSL 510□□□□□ -0.819e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-220ENST00000549002 566 ntTSL 29.85□□□□□ -0.839e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-215ENST00000548245 588 ntTSL 39.41□□□□□ -0.99e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-222ENST00000549589 571 ntTSL 49.09□□□□□ -0.959e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-237ENST00000552626 880 ntTSL 49.09□□□□□ -0.959e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-229ENST00000551472 608 ntTSL 49.01□□□□□ -0.979e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-212ENST00000547611 1224 ntTSL 1 (best)8.92□□□□□ -0.989e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SMARCB1-206ENST00000477836 660 ntTSL 28.9□□□□□ -0.989e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-211ENST00000547484 526 ntTSL 48.58□□□□□ -1.049e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-223ENST00000549624 542 ntTSL 48.41□□□□□ -1.069e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-232ENST00000551792 577 ntTSL 28.37□□□□□ -1.079e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-235ENST00000552031 540 ntTSL 48.37□□□□□ -1.079e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-225ENST00000550803 648 ntTSL 38.17□□□□□ -1.19e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-206ENST00000546398 2075 ntTSL 1 (best)7.12□□□□□ -1.279e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-217ENST00000548455 1024 ntTSL 36.39□□□□□ -1.399e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-226ENST00000551039 564 ntTSL 46.32□□□□□ -1.49e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0753-209ENST00000575027 753 ntTSL 45.73□□□□□ -1.491e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SENP3-206ENST00000581093 493 ntTSL 55.65□□□□□ -1.59e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-239ENST00000552821 482 ntTSL 55.56□□□□□ -1.529e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-241ENST00000553063 591 ntTSL 44.78□□□□□ -1.649e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-216ENST00000548371 999 ntTSL 34.54□□□□□ -1.689e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SENP3-207ENST00000582789 536 ntTSL 23.84□□□□□ -1.799e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.459e-11■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 312.76□□□□□ -0.379e-23■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 PNCK-230ENST00000488168 976 ntTSL 315.15■□□□□ 0.022e-17■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NOSTRIN-210ENST00000471833 553 ntTSL 30.22□□□□□ -2.376e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.022e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-244ENST00000555650 1588 ntTSL 213.58□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-258ENST00000556716 2718 ntTSL 210.4□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-218ENST00000553593 978 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-221ENST00000553793 725 ntTSL 27.19□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-272ENST00000557416 556 ntTSL 47.19□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NAPG-207ENST00000583367 3860 ntTSL 25.18□□□□□ -1.586e-9■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 FSD1L-205ENST00000480279 566 ntTSL 31.4□□□□□ -2.192e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 NPLOC4-203ENST00000570300 565 ntTSL 48.91□□□□□ -0.983e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 IL17RE-211ENST00000489181 2011 ntTSL 28.76□□□□□ -1.012e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 310.93□□□□□ -0.661e-18■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SLC7A6-215ENST00000568088 510 ntTSL 322.77■■□□□ 1.242e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ZMAT3-202ENST00000414084 743 ntTSL 49.14□□□□□ -0.952e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 DCAF11-234ENST00000561001 545 ntTSL 416.87■□□□□ 0.293e-9■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 DCAF11-233ENST00000560901 603 ntTSL 314.75□□□□□ -0.053e-9■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ARHGEF10L-208ENST00000482892 539 ntTSL 38.99□□□□□ -0.974e-12■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K11-213ENST00000534432 664 ntTSL 316.65■□□□□ 0.269e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 DHPS-212ENST00000596847 646 ntTSL 512.15□□□□□ -0.466e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.19e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AGPAT2-203ENST00000470861 720 ntTSL 218.44■□□□□ 0.549e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AGPAT2-204ENST00000472820 808 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.339e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.089e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.049e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 PNPO-207ENST00000584806 2940 ntTSL 35.93□□□□□ -1.462e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AC023055.1-204ENST00000548593 782 ntTSL 317.25■□□□□ 0.353e-10■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AC023055.1-202ENST00000550124 805 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-10■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AC023055.1-203ENST00000546813 646 ntTSL 36.91□□□□□ -1.33e-10■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 AC023055.1-205ENST00000552719 531 ntTSL 26.3□□□□□ -1.43e-10■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CYFIP2-217ENST00000611075 1000 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CYFIP2-218ENST00000611925 925 ntTSL 314.06□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CYFIP2-211ENST00000522637 580 ntTSL 413.92□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CYFIP2-224ENST00000622696 1294 ntTSL 213.53□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 CYFIP2-223ENST00000621516 915 ntTSL 59.81□□□□□ -0.841e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SMG1-204ENST00000561940 964 ntTSL 22.78□□□□□ -1.961e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ERBB3-212ENST00000549672 676 ntTSL 47.8□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.128e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.338e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.618e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 BRD8-215ENST00000460746 475 ntTSL 51.09□□□□□ -2.243e-6■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 UNC13D-209ENST00000587495 276 ntTSL 38.76□□□□□ -1.012e-8■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-PTCD1-202ENST00000437572 544 ntTSL 414.03□□□□□ -0.166e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-PTCD1-203ENST00000451138 331 ntTSL 413.41□□□□□ -0.266e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 PTCD1-204ENST00000430982 571 ntTSL 413.04□□□□□ -0.326e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-206ENST00000466753 774 ntTSL 210.61□□□□□ -0.716e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-204ENST00000414062 541 ntTSL 49.09□□□□□ -0.956e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.246e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.36e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.356e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.486e-7■■□□□ 11.6
PRPF8Q6P2Q9 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.796e-7■■□□□ 11.6
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1080.5 ms