Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 EEF1A1P13-201ENST00000503537 1389 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SUN3-202ENST00000395572 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR10G4-201ENST00000320891 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF738-202ENST00000380870 1142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GLS-205ENST00000409626 997 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC114760.1-201ENST00000420310 652 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 Z74696.1-201ENST00000428208 1123 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC018695.1-201ENST00000484096 664 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR4C9P-201ENST00000532368 925 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC027808.2-203ENST00000558261 638 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL121917.2-201ENST00000605044 390 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.46-201ENST00000611137 251 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SERPINC1-204ENST00000617423 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SAG-201ENST00000409110 1591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 EEF1A1P15-201ENST00000395772 1408 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 INTS4-211ENST00000535943 1382 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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