Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC023824.7-201ENST00000623041 5731 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MAST4-201ENST00000261569 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CD28-202ENST00000374481 4526 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 IRF1-201ENST00000245414 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 DSCAML1-201ENST00000321322 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC020658.3-201ENST00000568093 4028 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 UVSSA-201ENST00000324803 4441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC022441.1-201ENST00000512599 794 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ADAM3A-208ENST00000495171 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 CTNNA2-201ENST00000343114 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AP000997.2-201ENST00000564619 8400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms