Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CASC15-205ENST00000606336 1288 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AP003121.1-201ENST00000609845 414 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC010542.5-201ENST00000612427 382 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC244093.5-201ENST00000619606 718 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CU634019.6-201ENST00000623165 710 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MAGOHB-211ENST00000625272 319 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 WASF4P-201ENST00000444248 1494 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GJA10-201ENST00000369352 1652 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ESRP1-203ENST00000433389 3770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CST11-201ENST00000377007 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 FAM218BP-201ENST00000408897 458 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC009110.1-201ENST00000415422 558 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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PDCD1Q15116 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 KRT18P54-201ENST00000513396 748 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AP002991.1-201ENST00000539305 574 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 BCAP31P2-201ENST00000563143 399 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LCMT1-AS1-202ENST00000563962 766 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 BCAP31P1-201ENST00000565437 385 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 EIF4A1P9-201ENST00000576035 1207 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC021382.2-201ENST00000584547 922 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC011444.4-201ENST00000586415 418 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 C8orf48-201ENST00000297324 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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