Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4BQ9Y4P1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms