Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNSTRNQ9Y448 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms