Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAB39Q9Y376 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms