Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBNO2Q9Y2G9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBNO2Q9Y2G9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBNO2Q9Y2G9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBNO2Q9Y2G9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBNO2Q9Y2G9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBNO2Q9Y2G9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBNO2Q9Y2G9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SBNO2Q9Y2G9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms