Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HHLA3Q9XRX5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HHLA3Q9XRX5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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