Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETD1BQ9UPS6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SETD1BQ9UPS6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms