Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms