Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP8AP2Q9UKL3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP8AP2Q9UKL3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms