Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP25Q9UHP3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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