Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFIP11Q9UBB9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFIP11Q9UBB9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms