Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL9Q9P2J3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms