Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms