Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PARVAQ9NVD7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARVAQ9NVD7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms