Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms