Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms