Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms