Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms