Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms