Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms