Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIL1Q9H173 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms