Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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