Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms