Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms