Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms