Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms