Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPA33Q99795 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms