Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms