Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF11Q99590 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms