Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD1Q99460 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms