Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM47Q96LD4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms