Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms