Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms