Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRIG1Q96JA1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms