Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms