Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RTP4Q96DX8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTP4Q96DX8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms