Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKL1Q969V6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms