Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC1Q92574 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms