Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERVK_113Q902F9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms